1.新建立文件
File→newdesign.给建立的数据库命名同时设定路径。
注意：很多同学图画好了不知道保存的路径在这里要注意了(如上图所示)。
新建文件：File→new或者在空白处右击→new。建立相应的文件(十个选项，如下图所示)。
2.用Sch设计图
根据指定的题目要求画出原理图，在库里找不到的元件需自建元件。
注意：画完后，ERC检查(Tools→ERC)常会出错，一般情况下要检查电气连接，检查导线是否用错线，导线之间是否重叠，集成块的管脚属性，(Input/Output/Power)等的设置，是否有不必要的导线悬空(线、地线等)，元件标识是否重复等。
当元件库里面的元件与我们要求作的原理图元件不同的时候，我们需要通过编辑对元器件编辑，编辑完成后不要忘记按更新按钮UpdateSchewwwts。
3.用Sch的CreateNedist生成网络连接表
此顶设置在Design→CreateNedist。
4.进入编辑器
建立PCB文件与建立原理图方法一样。具体步骤：
(1)定义板框(一定要在KeepOutlayer有个边框)
(2)引入网络连接表，此项在设置在Desiga→LoadNets里面
注意：加载网络表时的常见错误有引线重叠，增加了节点；元件引脚间缺少引线；元件的序号(Designator)重复(Duplicate)；元件的封装(Footprint)与PCB所打开库的封装不一致；的网络号不正确。如：接地端没有改为GND，电源端没有改为V；元件引脚与封装引脚的编号不一致Nmber应该和封装引脚的序号Designator一致；(如图3、4所示，的nomber号1、2与diodeO.4的封装DesignatorA不一致，更改其一便可，习惯更改原理图)；自建的封装尚未加载到库里面(我们可以在加载网络表的时候打开自建的封装或者加载到库里面去)。
(3)放置元件(Component)
可先用自动布局(Tools→AutoPlacements)，再用手动布局进行调整。
注意：自动布局器(ClusterPlcaer)：适用于元件较少的电路板，整体布局器(StatisticalPlacer)适用于元件较多的电路板。
(4)置布线规则(Design→Rules)
注意：RoutingLayers(布线层)必须设置通常都设为水平或竖直，电源线和地线也应该一致，顶层走水平线，底层走竖直线；布线之前走线间距(ClearanceConstraint)和线宽约束(WidthConstraint)二者至少设置一项。
(5)自动布线(AutoRoute>A11)，手工调整
(6)保存、打印
Protel99SE是目前较为流行的，专业基础软件，要想学好它，必须从细节开始，每个环节都要仔细处理，这样才能快速的画好图，制作出电路板。
